经过《分子植物育种》编委会的不懈努力，从2010年10月开始，《分子植物育种》已经形成了印刷版（ISSN: 1672-416X），网络中文版（ISSN: 1923-8258），网络英文版（ISSN: 1923-8266）三个版本。
     《分子植物育种》全面采用国际通行的 Open Access 出版模式，在信息的交流与传播方面打破了传统的时空限制，使交流的范围大大扩展；在阅读和存取途径方面，强调“开放、自由、永久”。论文同一文件可以多种途径、多种方法检索与阅读，交流范围覆盖整个互联网，实现最大限度地扩大论文的影响力，最大限度地吸收读者群。
     《分子植物育种》网络版全面采用和接受《Creative Commons Attribution License》所有条款,进行的论文发布和传播。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三者无条件的使用、传播以及任何媒介的复制。
      根据《分子植物育种》编委会决定，自2011年开始，所有投稿到《分子植物育种》并获得接受的论文，都将在网络版优先发表。中文论文发表在中文网络版，英文论文发表在英文网络版。印刷版上只刊登在网络版上已经发表并经编委会审核的论文。
      凡是在《分子植物育种》英文网络版上发表的英文论文，《分子植物育种》中文网络版，可以接受该稿件的英译中版本的再次刊登。
     《分子植物育种》中文/英文网络版，具有适合在线阅读的HMTL格式和适合下载打印保存的PDF格式，每篇论文赋予独一无二的DOI编码，通过国际著名的 CrossRef 解析。论文已经接受即可理解获得这是发表。发表周期可缩短至最多1周。
     《分子植物育种》中文/英文网络版，改变了原来以版面页数收取相关费用的办法，执行国际上通用的“论文处理费”收取原则，2010年《分子植物育种》中文/英文网络版，中国大陆地区为每篇论文1800元。


                                                                                             《分子植物育种》编委会